以下应作废标处理吗？

根据招投标规定这应该是作为废标处理的，但也要看招标要求有无规定，若招标文件没规定，那就要看招标单位的处理意见了，作为有效标也是可以的。

在公开招标中，开标前：投标函和标书封面均已盖投标单位及法人代表章，相关造价专业人员也已签字盖章，投标书按照要求盖章密封。开标后：在对商务标进行分析时，发现投标文件中工程量清单封面没有盖投标单位及法人代表章，此单位应做废标处理吗？

这个要看招标文件要求，如果文件要求投标文件中工程量清单封面必须盖投标单位及法人代表章，那么你这个就是废标，如果没有特别要求，就应该是合格的，但是如果这个招标办的常规也是这么要求的，那么就是这回招标文件没有要求，那么你这也是废标。

    在公开招标中，开标前：投标函和标书封面均已盖投标单位及法人代表章，相关造价专业人员也已签字盖章，投标书按照要求盖章密封。开标后：在对商务标进行分析时，发现投标文件中工程量清单封面没有盖投标单位及法人代表章，此单位应做废标处理。