关于工程类别取费问题

我们在建的一个工程48000m2，其中有（学校）三栋宿舍（41000m2，6层）和一个食堂（约7000m2，2层），首层层高4.2m，以上为3.6m，全部都相连，投标时甲方提供的清单为整个工程的清单（如：梁，是3栋宿舍和食堂全部梁的工程量），投标时我们综合考虑为一类工程。开工前与甲方又签署一份补充协议，现场计算工程量，按河北08定额计算，现甲方将食堂部分定位二类工程，我们不同意，理由：投标时清单无分开，应综合考虑（补充协议无此说明）。请教大家，这工程应该按几类工程考虑？