结算时垂直运输费及使用材料品牌调整问题

1、我们一个商场的装饰装修工程，招标文件中对某些材料的提供了三个品牌供选择，而且还有有句话“上述三个品牌及同档次品牌”，投标时没有注明用于项目的材料品牌，但是商务标编制说明中写道“本报价材料所用品牌为符合国家标准的相关品牌”；

结算时，审计：根据合同条款“未按招标文件选用品牌，按合同价款1%违约处理”为由，按结算价的1%扣                              除。

      施工单位：招标文件为要求邀请，投标文件为要约，招标文件与投标文件不一致时，应以投标文件为准，                         合同解释顺序中投标文件在前。且违约按合同价1%，而不是结算价。审计理由不充分。

2、工程量清单中有垂直运输和超高增加费，勘探现场时主体已完工，室外的塔吊和施工电梯正在拆除，但是投标时还是按一个整体项目考虑的垂直运输费（未考虑“当主体结构和装饰不是同一施工单位实施时，装饰按垂直运输费20%，主体结构按80%记取”这一原则），而且进场使用的建设方已经安装好的正式电梯，没有另行采取垂直运输措施。合同中也只约定了“使用正式电梯需申请，并得到确认后方可使用，并承担电梯损坏、修复费用“其他费用未提及。

结算时，审计：“施工期间使用的建设方已安装的正式电梯，施工单位未另行采取垂直运输设备也未发生费用”为由扣除投标时的垂直运输费，且应按合同约定承担施工过程中电梯损坏、修复费用。

       施工单位： 我们认为合同中约定了损坏修复费用，这个费用我们可以承担，但是不能扣除投标时的垂直运输费，而且我们了解到，当时编制招标文件时是按“当主体结构和装饰不是同一施工单位实施时，装饰按垂直运输费20%，主体结构按80%记取”来计算的，但是我们投标时是按100%投标的，如果按投标文件扣除这个损失太大，所以我们提出三个方案①：我们承担施工期间正式电梯损坏、修复费用，但是投标报价总垂直运输费不得扣除；②审计应根据“当主体结构和装饰不是同一施工单位实施时，装饰按垂直运输费20%，主体结构按80%记取”原则，按投标报价中垂直运费的20%扣除；③投标报价垂直运输费不扣除，施工期间损坏、修复费用我们承担，另与建设方协商，按使用电梯台数及时间支付相关费用。

       写得有点啰嗦，请各位老师看看，以上问题，审计说的是否有道理，如果第二个问题按审计的原则来，我们后面三个方案是否可行？谢谢了